ATG5 regulates autophagy-apoptosis-ER stress dysregulation in steroid-induced osteonecrosis of the femoral head (SONFH) pathogenesis

Die Studie zeigt, dass ATG5 durch die Aktivierung des PERK-Signalwegs eine Überaktivierung der Autophagie und nachfolgende ER-Stress-induzierte Apoptose bei steroidinduzierter Osteonekrose des Femurkopfes (SONFH) antreibt, wobei eine gezielte ATG5-Silenzierung diesen pathologischen Prozess wirksam unterbricht.

Liu, K., Jiang, B., Liu, W. + 2 more2026-03-10📄 molecular biology

Hunting for Helminths: short- and long-read shotgun metagenomics for parasite detection in faecal samples

Die Studie validiert die Shotgun-Metagenomik zur Detektion von soil-transmitted Helminths in Stuhlproben und stellt fest, dass die Abbildung mitochondrialer Sequenzen die zuverlässigste Methode darstellt, wobei Kurzlese-Technologien (Illumina) Langlese-Verfahren (Nanopore) übertreffen und die Detektion bei niedrigen Infektionsintensitäten oder geringen DNA-Mengen jedoch weiterhin schwierig bleibt.

O'Brien, K., Elamaran, A., Dayi, M. + 12 more2026-03-10📄 molecular biology

Topological Regulation of the Mammalian Genome by Positive DNA Supercoiling

Diese Studie etabliert mithilfe quantitativer GapR-Profilierung, dass positives DNA-Supercoiling nicht nur durch Transkription, sondern auch durch R-Schleifen und Cohesin an regulatorischen Elementen sowie durch Kondensine während der Mitose entsteht, wodurch es als topologischer Speichermechanismus fungiert, der DNA-Mechanik mit Transkriptionskontrolle, Genomarchitektur und epigenetischer Vererbung verknüpft.

Singh, A. K., Altamirano-Pacheco, L., Taing, L. + 2 more2026-03-10📄 molecular biology

Evolution of Origin Sequence and Recognition for Licensing of Eukaryotic DNA Replication

Diese Studie untersucht die evolutionäre Entwicklung der DNA-Replikationsursprünge und deren Erkennung, indem sie die plastischen Protein-DNA-Interaktionen zwischen dem ORC-Cdc6-Komplex und variablen Ursprungssequenzen in der Hefe *Yarrowia lipolytica* aufklärt und diese Erkenntnisse mit der Struktur des menschlichen ORC-CDC6-Komplexes vergleicht.

Bauer, J., Zali, N., Chouhan, O. P. + 5 more2026-03-10📄 molecular biology

Mind the crack: Crack-arrest holes and soft-suspension support integration in cryo-lamella preparation for improved resistance to crack formation, fracture and deformation

Diese Arbeit stellt zwei innovative Modifikationen zur Herstellung von Kryo-Lamellen vor – Rissstopflöcher und eine weiche Feder-Aufhängung –, die die mechanische Stabilität erhöhen, Rissausbreitung verhindern und so die Ausbeute an intakten Proben für die Kryo-TEM-Imaging verbessern.

Gorelick, S., Trepout, S., Velamoor, S. + 2 more2026-03-09📄 molecular biology

The human DEAD-box protein DDX3X regulates host and viral mRNA translation during Sendai Virus infection

Die Studie zeigt, dass die menschliche RNA-Helikase DDX3X während einer Sendai-Virus-Infektion weiterhin an GC-reiche 5'-UTR-Regionen bindet, aber zusätzlich neu rekrutiert wird, um die Translation des IFNB1-mRNAs und damit die Produktion von Interferon-beta zu fördern, ohne dabei einen signifikanten Einfluss auf den viralen Lebenszyklus zu haben.

Ryan, C. S., Anastasakis, D. G., Polash, A. H. + 3 more2026-03-09📄 molecular biology

Establishing MS2-MCP-based single-molecule RNA visualization in Schizosaccharomyces pombe

Die Studie etabliert erstmals ein optimiertes MS2-MCP-System mit dem photostabilen Fluorophor StayGold für die Einzelmolekül-RNA-Visualisierung in der Spaltbackhefe Schizosaccharomyces pombe, indem sie durch systematische Optimierung von MCP-Expression und -Lokalisierung sowie von MS2-Stem-Loop-Tags die notwendige Balance zwischen Signalintensität und Hintergrundrauschen erreicht.

Weidemann, D. E., Turner, S. C., Hauf, S.2026-03-09📄 molecular biology

In-house produced MarathonRT comparison to uMRT and Induro in tRNA sequencing library preparation

Die Studie stellt eine kostengünstige, in-house hergestellte MarathonRT-Variante mit verbesserter Reinigung und Aktivitätsbestimmung vor, die in der tRNA-Sequenzierung eine gleichwertige Leistung zu kommerziellen Enzymen wie Induro und uMRT bietet und durch eine optimierte Extraktionsmethode den gesamten Workflow beschleunigt.

Pedor, J. K., Gregorova, P., Radesic, M. + 1 more2026-03-09📄 molecular biology

Mechanism of circZNF827-mediated transcriptional repression during neuronal differentiation

Die Studie zeigt, dass der circZNF827-HnRNP-Komplex während der neuronalen Differenzierung die Transkription des NGFR-Gens und weiterer Zielgene durch H3K27me3-vermittelte Repression unterdrückt und dabei initiale regulatorische Ereignisse auslöst, die eine sekundäre Antwort zur Verstärkung der Differenzierung bewirken.

Zaporozhchenko, I., Hollensen, A. K., Damgaard, C. K.2026-03-08📄 molecular biology

Optimized tRNA Structure-seq reveals robust tRNA secondary structures in S. cerevisiae under mild stress conditions

Die Studie stellt eine optimierte tRNA Structure-seq-Analyse vor, die durch die Berücksichtigung natürlicher tRNA-Modifikationen und verfeinerter Energieparameter eine Vorhersagegenauigkeit von 94 % für tRNA-Sekundärstrukturen in Hefe ermöglicht und zeigt, dass diese Strukturen unter milden Stressbedingungen intrinsisch stabil bleiben.

Yanagihara, K., Konishi, F., Matsuda, T. + 4 more2026-03-08📄 molecular biology

Preconceptional immunomodulation partially corrects pregnancy associated abnormalities induced by endometriosis in a mice model, with a normalization of transcriptional alteration observed in the developing fetal maternal interface at the single cell level.

Die Studie zeigt, dass eine präkonzeptionelle Immunmodulation in einem Mausmodell die durch Endometriose verursachten Schwangerschaftskomplikationen teilweise korrigiert und die damit verbundenen transkriptionellen Veränderungen an der fetomütterlichen Schnittstelle, insbesondere in den Dezidualstromazellen, normalisiert.

BOUZID, K., BARTKOWSKI, R., SOUCHET, C. + 12 more2026-03-07📄 molecular biology

Analysis of genes co-evolved with Igf2bp RNA-Binding Proteins provides insights into post-transcriptional regulatory networks

Diese spekulative Übersichtsarbeit analysiert die evolutionäre Koevolution von Igf2bp-RNA-bindenden Proteinen mit Genen, die für die neuronale Entwicklung und Tumorigenese relevant sind, und schlägt ein Modell vor, wonach diese Proteine im Nervensystem als Koordinatoren der posttranskriptionellen Genregulation entstanden und später in Krebszellen zur Stabilisierung onkogener Genexpressionsprogramme umfunktioniert wurden.

Yisraeli, J. K., Izraely, S., Tabach, Y.2026-03-07📄 molecular biology